Этап 3

   Дальнейшему развитию Зоопарка помешала начавшаяся в 1941 году Великая Отечественная Война. Первая оккупация, длившаяся с 21 по 28 ноября 1941 года, напрямую не затронула зоопарк – немецкие войска не находились на его территории. Вторая оккупация, начавшаяся 24 июля 1943 года, стала тяжёлым испытанием, в котором сотрудники зоопарка проявили стойкость и мужество. Сохранить зоопарк в годы войны было непросто. Сотрудники и их семьи старались прокормить и обогреть своих питомцев. Наличие своего подсобного хозяйства с огородом и фруктовым садом несколько улучшало ситуацию с провиантом. Труднее было с топливом. Все помещения в то время отапливались дровами, всего было 24 печи. На топливо пошли ограда зоопарка, некоторые вольеры, сухие деревья, а из навоза и строительного мусора делали брикеты, которые так же годились для отопления.


   Усилия сотрудников оказались не напрасными. Многих животных зоопарка удалось сохранить, кроме экспозиции террариума и аквариума, обитатели которой погибли по причине недостаточного обогрева.
Сразу же после освобождения Ростова началось восстановление зоопарка. Комиссия по определению нанесенных войной убытков работала в 1945-1946 годах. Зоопарк ограждался колючей проволокой, восстанавливалось водоснабжение, линии электроснабжения, была приобретена электроподстанция. На 1 января 1946 года в коллекции зоопарка насчитывалось 36 видов животных – 481 экземпляр. В 1947 году были открыты отдел с хищных млекопитающих и аквариум Для посетителей зоопарк был открыт в 1947 году.